小时候的萧亚轩和弟弟在乡下的外婆家度过，受过日式教育的外婆，不仅没有对姐弟俩过分溺爱，反而管教得十分严厉，当时活泼好动的萧亚轩自幼受传统式教育，对于长大后的梦想，从未想过与唱歌和舞台有关。小学时期，萧亚轩在乐队吹口风琴，与此同时，她也是田径队的队员。
1996年，17岁的萧亚轩离开家里，远赴加拿大温哥华学习服装设计。
1998年，在朋友的鼓动下，萧亚轩参加了香港TVB主办的《华人新秀歌唱大赛》。
1999年，萧亚轩发行个人首张同名专辑《萧亚轩》，在中国台湾销售超过50万张，成为年度台湾唱片销量冠军，她凭借该专辑获得中国时报十大超人气歌手；同年，萧亚轩在EMI全球年度大会上，取代了宇多田光，成为销售冠军新秀。
2000年8月15日，萧亚轩发行第二张专辑《红蔷薇》，而她则凭借该专辑的歌曲《一个人的精彩》获得了第七届华语榜中榜最受欢迎歌曲奖；8月26日，举办个人第一场售票演唱会萧亚轩“夏日蔷薇”演唱会；同年，萧亚轩凭借《萧亚轩》《红蔷薇》两张专辑，成为由IFPI认证（1999-2000）全球华语唱片最高销量歌手，并获得1999年至2000年度世界音乐奖全球年度销售最佳华语歌手奖。2001年，萧亚轩发行第三张专辑《明天》，并在香港红磡体育馆举办两场“夏日的精彩”演唱会，并成为继张惠妹后，第二位登上红磡体育馆举办演唱会的中国台湾女歌手。
2002年，萧亚轩先后发行了第四张专辑《4U》和第五张专辑《爱的主打歌·吻》；1月25日，获得第八届华语音乐榜中榜颁奖典礼最佳魅力歌手奖；8月，连续在香港红磡体育馆举办两场“闪耀萧亚轩”演唱会。
2003年，萧亚轩重回在台北市立体育场举办“萧亚轩Up2U台北演唱会”；5月16日，发行个人第六张专辑《爱上爱》，而她凭借该专辑获得马来西亚1988年度最佳对唱歌曲奖、台北HITO流行音乐年度十大金曲奖等多个奖项；随后，萧亚轩也和Hinet协作，成为华人乐坛首创付费下载的第一位歌手-2003年数位单曲《我就是我》；7月11日，在新加坡举行up2u狮城演唱会；12月30日，发行个人第七张专辑《第5大道》，收录了包括《来自第五大道的明信片》、《因为爱》等在内的11首歌曲，而她则凭借该专辑获得了第二届东南劲爆中国台湾地区最旺人气、港台地区劲爆最受欢迎女歌手奖；专辑歌曲《你是我心中的一句惊叹》获得港台劲爆十大金曲奖。2004年5月，萧亚轩与维京唱片解约；7月16日，推出个人首张精选集《首选萧亚轩…美丽的插曲》，随后，与经纪人陈香君共同筹组经纪公司万力达娱乐；8月，萧亚轩凭借歌曲《爱的主打歌》获得第一届东南劲爆音乐榜内地劲爆十大金曲奖；同年，其参与配音工作的动画电影《蝴蝶梦：梁山伯与祝英台》上映。
2005年3月23日，萧亚轩与华纳音乐签订唱片合约，但一年内未发行专辑，因而合约失效；4月22日，参加MusicRadio中国TOP排行榜颁奖晚会，并演唱歌曲《爱的主打歌》；12月16日，参加娱乐新闻节目《娱乐百分百》。2006年10月，与总经理刘天健陈香君达成共识，以1亿2000万元签约金和预付版税，再度签约华纳音乐；10月19日，推出个人原创单曲《Elva is back》；10月23日，担任蔡依林“唯舞独尊手牵手宝贝我”世界巡回演唱会的嘉宾；12月6日，参加电视谈话性娱乐节目《康熙来了》；12月22日，推出个人音乐专辑《1087》，收录了包括《表白》、《Honey Honey Honey》等在内的10首歌曲，而她则凭借该专辑获得了香港新城国语力颁奖礼新城国语力舞台大奖、新城国语力女歌手奖。
2007年3月，联手音乐之声推出《Elva我要的世界》音乐爱情情景广播剧；8月，参加“为奥运加油”冰舞晚会；11月，获得MTV超级盛典台湾最具风格女歌手奖。2008年1月17日，获得新浪网络盛典年度港台女歌手奖以及港台全能艺人奖；7月4日，参加“前进奥运、中华健儿加油”音乐会。6月10日，参与录制节目《综艺大哥大》；7月13日，获得大学生音乐节大学生最爱女歌手奖。2008年4月22日，萧亚轩再次加入维京音乐（现已改为金牌大风）；6月15日，发行第九张专辑《三面夏娃》，收录了包括《类似爱情》、《两个人的寂寞》等在内的12首歌曲，而她则凭借该专辑获得了第九届音乐风云榜港台最佳女歌手奖、MusicRadio中国TOP排行榜港台最受欢迎女歌手、Topinmusic-IN乐榜港台彰榜牌两周冠军等多个奖项。7月，萧亚轩获得了新城国语力女歌手、跳唱歌手奖、亚洲歌手奖，其中歌曲《I'll Be There》则获得了新城国语力歌曲奖。
2009年4月，获得MusicRadio中国TOP排行榜港台地区最受欢迎女歌手奖；10月9日，推出个人第十张专辑《钻石糖》，收录了包括《闪闪惹人爱》、《倒数》等在内的10首歌曲，这也是她出道十年所发行的专辑，其中参与作词2首，而她则凭借该专辑获得了全球华语音乐榜中榜最受欢迎女歌手奖；10月31日，参加云南卫视《音乐集结号》；11月16日，出席“一鸣金人——全球流行音乐金榜新闻发布会”；12月31日，举行"萧亚轩“WOW”世界巡回演唱会"；同年，萧亚轩凭借专辑《三面夏娃》获得第九届音乐风云榜港台最佳女歌手奖。2010年3月28日，获得第14届全球华语榜中榜最受欢迎女歌手奖以及最佳舞台造型奖；4月，获得2009年度中国Top排行榜年度最受欢迎女歌手以及年度全能艺人；9月，再度签约金牌大风；4月5日，获得中央人民广播电台MusicRadio中国TOP排行榜港台年度全能艺人奖和港台年度最受欢迎女歌手奖；9月24日，发行第11张专辑《萧洒小姐》，其中萧亚轩参与创作了5首词、2首曲，同时尝试制作2首自己的全创作，萧亚轩也凭该专辑获得了MusicRadio中国TOP排行榜港台年度最佳舞台演绎奖；第五届无线音乐最畅销港台女歌手奖；其演唱的歌曲《潇洒小姐》以852万次下载量获得最畅销劲舞金曲奖；12月，萧亚轩在上海举办了个人的WOW世界巡回演唱会。2011年1月16日，其参与拍摄的MV《潇洒小姐》获得年度数位最佳人气MV奖；1月27日，其参与配音工作的动画电影《老夫子之小水虎传奇》上映，为陈小姐配音；2月14日，受Jamie Foxx邀请参加第53届格莱美奖颁奖典礼，并成为首位登上格莱美红毯的台湾歌手；4月15日，获得第十五届全球华语榜中榜港台最受欢迎女歌手奖；12月22日，获得苹果娱乐音乐大赏最佳人气女歌手奖；12月23日，推出个人第12张概念专辑《我爱我》，并首拍爱情微电影《100分的吻》配合专辑宣传，而她则凭借该专辑获得了HITO流行音乐奖华语十大金曲奖、全球唱跳女艺人奖以及最佳舞台造型奖等多个奖项；12月24日，举行《ELVA我爱我Many X'mas 新歌演唱会》。2012年1月9日，录制中视《我猜我猜我猜猜猜》新春特别节目；1月11日，参加电视谈话性娱乐节目《康熙来了》；1月13日，参与录制《综艺大本营》过年特别节目；1月16日，参加东方卫视春节联欢晚会；随后，其参与拍摄的MV《逞强》入围年度最受欢迎MV；2月21日，推出个人第三张精选集《Super Girl 爱无畏 新歌+精选集》，而她则凭借该专辑获得了第24届台湾金曲奖最佳音乐录影带奖提名、第17届华语榜中榜Channel V亚洲风尚歌手奖、最受欢迎女歌手奖等多个奖项；5月，出席第53届格莱美颁奖礼；12月，参加湖北卫视新年环球狂欢夜跨年演唱会。2013年1月，参加江苏卫视跨年演唱会，并演唱歌曲《Super girl 爱无畏》、《潇洒小姐》、《我爱我》、《爱的主打歌》及《表白》；4月25日，获得MusicRadio中国TOP排行榜年度最佳女歌手奖，其中，其演唱的歌曲《Super Girl 爱无畏》获得年度金曲奖；8月1日，签约索尼音乐，收获索尼音乐订购的以ELVA HSIAO命名的行星为见面礼，并制定“星球大战之五星计划”；10月20日，参加东方风云榜汽车音乐节；12月5日，为微电影《傻东西》演唱的主题曲《傻东西》正式上线。
2014年8月，萧亚轩推出专辑《不解释亲吻》，收录了包括《不解释亲吻》、《浪漫来袭》等在内的11首歌曲；9月，参加湖南卫视《快乐大本营》；11月，在广东卫视励志真人秀节目《中国好男儿》中担任导师。2015年1月，她凭借歌曲《不解释亲吻》获得全球流行音乐金榜2014下半年度20大金曲奖；4月16日，获得第19届“全球华语榜中榜”最佳女歌手奖以及最佳舞台表现力奖；7月，获得蒙牛酸酸乳MusicRadio中国TOP排行榜最受欢迎港台女歌手；11月13日，其参与录制的户外竞技真人秀节目《奔跑吧兄弟》在浙江卫视播出；12月，参加台北市跨年舞台演出；同年，出席春夏巴黎夏姿陈秀场。
2016年1月，其参与录制的时尚音乐纪录片《和自己唱首歌》在土豆视频播出；7月，萧亚轩参加了湖南卫视互动音乐综艺节目《我想和你唱第一季》，以想唱嘉宾身份与阿云嘎演唱歌曲《最熟悉的陌生人》；同年，参与江苏卫视推理神秘音乐秀《看见你的声音》。
2017年1月25日，登上安徽卫视春节联欢晚会，演唱歌曲《表白》和《最熟悉的陌生人》；7月28日，为电影《心理罪》演唱推广曲《明天的秘密》。
2018年5月4日，为网络剧《动物系恋人啊》演唱的片头曲《舞舞舞》正式上线。
2019年12月20日，萧亚轩推出专辑《Naked Truth》首支主打歌《当你和心跳一起出现》。
2020年2月，携男友黄皓参与其录制的节目《吐槽大会第四季》在腾讯视频播出；3月11日，萧亚轩推出的专辑第二支歌曲《不如先庆祝能在一起》在全球数字音乐平台上线；10月18日，携男友黄皓参加芒果TV情感观察真人秀《女儿们的恋爱第三季》；12月24日，推出专辑《Naked Truth》，收录了《不是东西》《大师讲》等在内的10首歌曲。
2004年，参与三王一后“爱的希望2004”慈善筹款演唱会，共募得300万元捐给善牧基金会。2005年，参加送爱到南亚赈灾晚会；9月27日，与马英九代言“9.27”台北国际无车日。2007年，与众多演艺明星一起录制奥运倒计时一周年主题曲《we are ready》；同年，担任台湾癌症基金会关怀大使，并与王金平拍摄公益广告。
2008年，萧亚轩与马英九一起出席女童军总会在台北青年公园举办的庆祝妇女节路跑；5月，参加“凝聚每份爱”震救灾义演，以个人名义向5.12汶川地震捐款50万人民币，并参与“把爱传出去 四川赈灾晚会”；6月，为四川地震携手胡彦斌演唱歌曲《我们的爱》，并参与SMG著名慈善节目《闪电星感动》为灾区募款60余万元，是灾区孩子最喜爱的慈善明星。2009年，萧亚轩参加赈灾募款晚会“把爱传出去”，向台湾捐款200万新台币。2010年1月8日，与黄晓明一起拍摄世博歌曲《Better City，Better Life》的MV；1月，参加“抗旱救灾－－我们在行动”公益晚会，并演唱歌曲《生生不息》；4月15日，免费接下推广子宫颈癌抹片检查的公益广告代言，为国民健康局担任子宫颈癌防治宣导大使；6月，与黄立行担任一连串饥饿三十“饿梦不再 救要现在”的活动代言人；同年，录制公益单曲《让每天都是圣诞节》，并与台湾世界展望会的认养橘手环活动结合，所得钱款全数捐出。2011年，萧亚轩捐款100万台币给红十字总会，除援助日本外，也对云南等天灾严重地区伸出援手；TVBS基金会，萧亚轩捐物义卖募款；为大人物慈善摄影展的青少年圆梦基金募得60万。
2012年，萧亚轩与红心字会与POP Radio合办CoCo Love一块，发现爱公益活动，写下LOVE ME卖出约1万；Marie Claire美丽佳人与妇女救援社会福利事业基金会勇敢公益大使；4月15日，参与台北公益活动《爱在四月天》。2013年，萧亚轩捐出蜜糖吐司一周的营业所得给伊甸基金会；9月，赴蒙古国探视认养贫童，以家扶国外贫童亲善大使的身份发讯息号召好友加入认养行列，回国后又再增加认养5名蒙古、吉尔吉斯与史瓦济兰儿童；12月14日，参与“两岸情.天使心”蒲公英的梦想演唱会，并担任蒲公英梦想大使。
2014年8月，为高雄气爆事件出席赈灾募款晚会；12月，担任某彩妆品牌世界艾滋日公益大使，并出席公益活动，认购200支公益唇膏转赠给需要的团体。
2015年4月，出席“爱在四月天”慈善晚会；11月5日，参加台湾第21届公益募捐活动，并亲自设计彩绘脸卡。2016年3月，参加“天佑台南－台南震灾祈福晚会”；8月，为“爱最大”演唱会担任表演嘉宾，并呼吁同志婚姻平权；10月14日，参加在重庆人民大礼堂举行的“音爱无限”公益演唱会。
2017年5月，为“国际不再恐同日”发声，录制公益歌曲《WE ARE ONE》；7月，萧亚轩在在台北信义广场的街头救助受伤的狗狗；其后，以关怀弱势儿童的基金会发文，赞扬萧亚轩多年来的善举，默默认养家扶基金会的孩子长达10年，截至17年她在世界各地共认养12名儿童；11月17日，为自己发起的流浪动物“毛小孩”T恤义卖发声。
2019年6月20日，四川省科技扶贫基金会官博晒出萧亚轩捐款证书，表示萧亚轩为宜宾地震灾区捐赠善款20万元支持灾区的救援行动与灾后重建。上海世博会活动图
在为电影演唱推广曲时，萧亚轩以献深情温婉的细腻唱腔，搭配凄美虐心的歌词，将电影情节纯真美好而带有无尽遗憾的感情演绎得刻骨铭心。萧亚轩很懂事，很有自己的想法，也很有潜力，有许多让人喜爱的地方，比如她的外形、舞台上的魅力等等。（新浪娱乐、歌手张惠妹、黄立行评）
她很时尚，全身上下只要跟她接触过的东西，就会与众不同。她是主流歌手里少有具有明星气质的艺人，虽然在演绎上的表现不如以前，但不能说对音乐不用心，只是用心的程度或是与日俱减，这也就变相使得她的音乐越来越不具惊喜性、惊艳性。但是，大众仍期待她音乐中具有的潮流性、引领性、时尚性——这些特色看起来似乎没什么内涵，却不是任何一个歌手的流行专辑可以兼备的。（陶晶莹、媒体撰稿人Sean、腾讯娱乐评）