1955年3月17日，出生于安徽芜湖。
幼年，上了当时芜湖市青山街（现为育红）幼儿园。
1961年，入学芜湖市第一中心小学，并进入市里六年制改五年制的教学改革试点班。
1968年，进入东方红中学读书。
1970年春季，进入恢复后的芜湖一中继续学习。
1973年，被分配到芜湖市教育局临时帮忙，做一些简单的行政工作。
1974年初，被分到芜湖二十中，担任一名化学老师，兼配合团委
书记做共青团的工作。1977年12月10日，参加高考。
1982年，毕业于中国科学技术大学近代化学系化学物理专业。2月，赴美国纽约州立大学石溪分校，师从朱鹏年教授。
1987年9月，获美国纽约州立大学石溪分校哲学博士学位，继续在该校化学系任博士后研究员至1989年5月。
1989年至1992年，在德国巴斯夫公司：先为洪堡基金会Fellow，在Dieter Horn博士的指导下同Wolfgang Schrof博士合作一年；后获永久雇用，任固体和高分子物理部、分散体系组激光光散射实验室主管。
1992年，辞去德国巴斯夫公司永久职位后前往香港中文大学任教，任英制讲师（Lecturer）。
1995年，受聘为中国科学技术大学化学物理系教授。
1996年至1999年，任香港中文大学教授。
1996年，获国家杰出青年基金资助。
1999年起，任香港中文大学化学讲座教授。
2000年，任香港中文大学伟伦化学讲座教授。
2003年，当选为中国科学院院士。
2004年，任合肥微尺度物质科学国家实验室低维物理与化学研究部主任。
2005年1月起，受聘担任中国科学技术大学化学学院院长。
家庭背景
1984年年底，吴奇的太太（在芜湖师范的同学）到石溪学习，1986年年初儿子在石溪出生，1987年年底有了女儿洋石，他的太太也获得了英语外教硕士和语言学博士。
学生生涯
吴奇的小学上的是试点班，芜湖只有两个班，课本从北京运过来，数学和语文老师都是特级小学教师。他的中学化学、语文老师是合肥师院的大学教师，数学老师是安徽师院的老讲师。
走上讲台
吴奇1972年高中毕业，正值邓小平复出，因为安徽中学教师不够，于是从文革后第一届高中生挑选民办教师，在芜湖从3600名学生挑选了120名左右。这批人考试录取后集中到师范学校强化训练半年多，吴奇在数理班受训，分去教初三化学。
吴奇是世界上最权威的激光光散射专家之一，他和其实验室以在高分子溶液、凝（冻）胶网络、纳米粒子和自组装方面的工作成名。（《中国科学报》评）
吴奇是激光光散射领域的国际权威，擅长借助化学手段，雕刻物理问题。他对深入理解高分子溶液中链的构象、动力学和相变化作出了重要的贡献。（合肥微尺度物质科学国家研究中心评）