1938年（昭和13年）1月25日，石森章太郎出生于宫城县登米郡石森町（现：登米市中田町石森）。
中学时代，在《毎日中学生新闻》上投稿四格漫画并入围，之后成为投稿狂。宫城县佐沼高中入学后，成立了“「东日本漫画研究会」”，制作了亲笔传阅杂志《墨汁一滴》。
此时漫画业界已经评价他为“宫城県に天才がいる”。绰号是“じゃがいも”。
1954年（昭和29年），就读高中时在《漫画少年》新年号上以漫画《二级天使》正式出道。第二年高中毕业，为了治疗姐姐的病和姐姐来到东京。住在以手冢治虫为首的众多漫画家们居住的常盘庄。
1958年（昭和33年）4月，姐姐去世，石森章太郎失去了最能理解她的姐姐，对后来的作画风格也产生了很大的影响。
1964年（昭和39年）7月19日，代表作《人造人009》开始连载。
这个时期描绘的石森的漫画入门书《マンガ家入门》（1965年）《続・マンガ家入门》（1966年）从当时开始就被广泛阅读。
另外，在连载《人造人009》的时候，因为收粉丝信的地址是自己家的地址，所以很多读者都来拜访。
1971年（昭和46年），在与假面骑士系列、超级战队系列的创造者之一的渡边亮德（东映本社原副社长、当时的东映电视部事业本部长）的相遇和巨大支持下，开始特摄作品《假面骑士》的原作及漫画化。
1981年（昭和56年），担任日本漫画家协会理事。
1985年（昭和60年），以绘画30年为契机，从“石森章太郎”改名为“石ノ森章太郎”。
1989年（平成元年），发表漫画中不仅有“有趣、搞笑”的表现形式，还有很多其他的表现形式成为可能，提倡新的漫画名称“万画”，发表了“万画宣言”。之后他将自己的职业称为“万画家”而不是“漫画家”。
1998年（平成10年）1月28日凌晨2点33分，因淋巴瘤导致心力衰竭在东京都文京区的顺天堂医院去世，享年六十岁。
2008年1月24日，吉尼斯世界纪录认定为“「1人の著者によって出版された最多コミックの记録」”。
他的漫画杰作已出版768种，正整理全集发行中。他的故乡宫城县石卷
市，正在进行《漫画爱的世界。石之森万画馆》的工程。这儿是一个岛，是一个《以漫画家与大自然共生的灵感和活力，结合了孩子们的梦想之岛，并且成为市民的文化设施中心。》这儿将蒐藏石之森章太郎20万张原画，展示给大众欣赏。并且日本宫城县的登米郡中田町亦盖了一座《石之森章太郎故乡纪念馆》。这儿有他出道前的足迹检证主题馆，还有大师为该馆绘作的作品主题区。另外，也有对大师笔下的机器人、漫画角色、日本文化的立体介绍。也将他在东京住过《常盘庄》现场再现，来纪念大师走过的足迹。