秦鹏飞自幼喜欢武术，1994年到无极县燕赵武馆学习武术，期间蝉联获得河北省武术冠军，被评为河北省一级运动员，并获得体育道德风尚奖称号。2000年进入河北省武术队从事专业训练，期间代表中国友好访问出国表演多次，并在全国武术比赛中被评为国家运动健将全国武英级运动员。
2005年进入影视圈在电影《墨攻》剧组从事武打替身工作，后参与《白银帝国》、《赤壁》、《画皮》、《剑雨江湖》、《花木兰》(赵薇版动画版)、《十月围城》、《古剑奇谭2》等多部影片的拍摄。
2005年，秦鹏飞参演电影《墨攻》，与刘德华、范冰冰合作；2006年，参演电影《功夫咏春》，与洪金宝、谢霆锋、元彪合作；同年参演《白银帝国》，与张铁林、郭富城、郝蕾合作；2007年，参演电影《赤壁》，与梁朝伟、金城武、胡军、林志玲合作；同年参演电影《画皮》，与甄子丹、陈坤、周迅、赵薇合作。
2008年，秦鹏飞参演电影《夺标》，与张卫健、谢苗合作；同年和冯绍峰、尤勇合作参演电视剧《在向虎山行》；同年参演电影《花木兰》，与陈坤、赵薇合作。2009年，参演电影《十月围城》，与甄子丹、黎明、谢霆锋等合作；同年参演电影《功夫咏春》，与白静、周兆龙合作；同年与杨紫琼、郑雨盛共同出演电影《剑雨江湖》。
2010年，秦鹏飞在电影《君子道》《龙凤店》、电视剧《桥隆飙》《逃亡者》中担任动作指导。
2011年，在电影《大魔术师》、电视剧《自古英雄出少年》《忽必烈传奇》中担任动作设计。
2012年，在电影《逃出生天》《聂隐娘》、电视剧《风花雪月》中担任动作导演。
2013年，在电视剧《千金归来》、电影《白发魔女》、数字电影《干掉客户》中担任动作指导。
2014年，秦鹏飞在电影《三少爷的剑》、电视剧《通天密码狄仁杰》 中担任动作设计。
2015年，在电影《封神传奇》《睡在我上铺的兄弟》《战神戚继光》 中担任动作导演。
2016年，在电视剧《凤凰无双》、电影《古剑奇谭2》中担任动作导演。
1997年至2000年参加河北省武术比赛蝉联四年获得刀术、棍术、规定拳第一名;
2001参加全国青少年武术锦标赛中获得刀术第一名，棍术第二名，自选拳第二名;
2002年参加全国男子锦标赛获得三节棍术第3名;
2004年参加男子全国锦标赛获得四项全能第三名。
秦鹏飞为人仗义、性格豪爽，颇具武者风范，大多数与其合作过的演员、电影人等都对他给出了很高的评价。从运动健将到武打演员、武术导演，秦鹏飞在影视制作道路上获得诸多荣誉的同时，也为观众留下了无数经典的作品。